Die studienbegleitende Förderung bezieht sich auf vier Semester nach dem Vordiplom, in denen die Vorteile des herkömmlichen Universitätsstudiums mit den Vorzügen einer privaten Hochschule ergänzt werden. Der Fokus der Bayerischen Eliteakademie liegt dabei auf Persönlichkeitsentwicklung, Förderung von Führungsfähigkeit, Konfliktfähigkeit, Teamfähigkeit, Medienkompetenz und interkultureller Kompetenz. Es wird bewusst darauf geachtet, die reine »Hörsaalatmosphäre« zu verlassen: Jährlich zwei vierwöchige Präsenzphasen und eine einjährige, praxisnahe Projektarbeit, die von Tutoren aus der Wirtschaft und den Universitäten begleitet wird, sind Teil des Förderprogramms.

Jeder der Studierenden erhält darüber hinaus einen persönlichen und nur ihm zugeteilten Mentor aus den Führungsetagen der Wirtschaft - seit 2001 auch von O₂ - damit ein möglichst unmittelbarer Einblick in den Alltag eines Entscheidungsträgers ermöglicht wird. Ferner werden über Förderfirmen wie O₂ entsprechend qualifizierte Auslandspraktika für Studierende organisiert.